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Phenols content and 2-D electrophoresis protein pattern: a promising tool to monitor Posidonia meadows health state.
BMC Ecology ( IF 3.368 ) Pub Date : 2007-08-01 , DOI: 10.1186/1472-6785-7-6
Luciana Migliore 1 , Alice Rotini , Davide Randazzo , Nadia N Albanese , Agata Giallongo
Affiliation  

BACKGROUND The endemic seagrass Posidonia oceanica (L.) Delile colonizes soft bottoms producing highly productive meadows that play a crucial role in coastal ecosystems dynamics. Human activities and natural events are responsible for a widespread meadows regression; to date the identification of "diagnostic" tools to monitor conservation status is a critical issue. In this study the feasibility of a novel tool to evaluate ecological impacts on Posidonia meadows has been tested. Quantification of a putative stress indicator, i.e. phenols content, has been coupled to 2-D electrophoretic protein analysis of rhizome samples. RESULTS The overall expression pattern from Posidonia rhizome was determined using a preliminary proteomic approach, 437 protein spots were characterized by pI and molecular weight. We found that protein expression differs in samples belonging to sites with high or low phenols: 22 unique protein spots are peculiar of "low phenols" and 27 other spots characterize "high phenols" samples. CONCLUSION Posidonia showed phenols variations within the meadow, that probably reflect the heterogeneity of environmental pressures. In addition, comparison of the 2-D electrophoresis patterns allowed to highlight qualitative protein expression differences in response to these pressures. These differences may account for changes in metabolic/physiological pathways as adaptation to stress. A combined approach, based on phenols content determination and 2-D electrophoresis protein pattern, seems a promising tool to monitor Posidonia meadows health state.

中文翻译:

苯酚含量和2-D电泳蛋白质图谱:监测Posidonia草甸健康状况的有前途的工具。

背景技术地方性海草波塞冬草(Posidonia oceanica(L.)Delile)定居在软底上,生产出高产草甸,在沿海生态系统动态中发挥关键作用。人类活动和自然事件导致广泛的草地退化。迄今为止,识别监测保护状态的“诊断”工具是一个关键问题。在这项研究中,已经测试了评估生态系统对波西多尼亚草甸的影响的新颖工具的可行性。假定的应激指标(即酚含量)的定量已与根茎样品的二维电泳蛋白质分析相结合。结果使用初步的蛋白质组学方法确定了根茎假单胞菌的总体表达模式,通过pI和分子量表征了437个蛋白斑点。我们发现蛋白质的表达在属于高酚或低酚部位的样品中有所不同:22个独特的蛋白质斑点是“低酚”的独特特征,另外27个斑点表征“高酚”的样品。结论波西多尼亚在草地上显示酚的变化,这可能反映了环境压力的异质性。另外,比较2-D电泳图谱可以突出显示响应这些压力的定性蛋白质表达差异。这些差异可以解释为适应压力而引起的代谢/生理途径的变化。基于酚含量测定和二维电泳蛋白质图谱的组合方法似乎是监测波西多尼亚草甸健康状况的有前途的工具。22个独特的蛋白质斑点是“低酚”的特有蛋白,另外27个斑点则表征了“高酚”的样品。结论波西多尼亚在草地上显示酚的变化,这可能反映了环境压力的异质性。另外,比较2-D电泳图谱可以突出显示响应这些压力的定性蛋白质表达差异。这些差异可以解释为适应压力而引起的代谢/生理途径的变化。基于酚含量测定和二维电泳蛋白质图谱的组合方法似乎是监测波西多尼亚草甸健康状况的有前途的工具。22个独特的蛋白质斑点是“低酚”的特有蛋白,另外27个斑点则表征了“高酚”的样品。结论波西多尼亚在草地上显示酚的变化,这可能反映了环境压力的异质性。另外,比较2-D电泳图谱可以突出显示响应这些压力的定性蛋白质表达差异。这些差异可以解释为适应压力而引起的代谢/生理途径的变化。基于酚含量测定和二维电泳蛋白质图谱的组合方法似乎是监测波西多尼亚草甸健康状况的有前途的工具。结论波西多尼亚在草地上显示酚的变化,这可能反映了环境压力的异质性。另外,比较2-D电泳图谱可以突出显示响应这些压力的定性蛋白质表达差异。这些差异可以解释为适应压力而引起的代谢/生理途径的变化。基于酚含量测定和二维电泳蛋白质图谱的组合方法似乎是监测波西多尼亚草甸健康状况的有前途的工具。结论波西多尼亚在草地上显示酚的变化,这可能反映了环境压力的异质性。另外,比较2-D电泳图谱可以突出显示响应这些压力的定性蛋白质表达差异。这些差异可以解释为适应压力而引起的代谢/生理途径的变化。基于酚含量测定和二维电泳蛋白质图谱的组合方法似乎是监测波西多尼亚草甸健康状况的有前途的工具。这些差异可以解释为适应压力而引起的代谢/生理途径的变化。基于酚含量测定和二维电泳蛋白质图谱的组合方法似乎是监测波西多尼亚草甸健康状况的有前途的工具。这些差异可以解释为适应压力而引起的代谢/生理途径的变化。基于酚含量测定和二维电泳蛋白质图谱的组合方法似乎是监测波西多尼亚草甸健康状况的有前途的工具。
更新日期:2019-11-01
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