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Aurantimonas manganoxydans, sp. nov. andAurantimonas litoralis, sp. nov.: Mn(II) Oxidizing Representatives of a Globally Distributed Clade of alpha-Proteobacteriafrom the OrderRhizobiales
Geomicrobiology Journal ( IF 2.3 ) Pub Date : 2009-03-13 , DOI: 10.1080/01490450902724840
C R Anderson 1 , G J Dick , M-L Chu , J-C Cho , R E Davis , S L Bräuer , B M Tebo
Affiliation  

Several closely related Mn(II)-oxidizing alpha-Proteobacteria were isolated from very different marine environments: strain SI85-9A1 from the oxic/anoxic interface of a stratified Canadian fjord, strain HTCC 2156 from the surface waters off the Oregon coast, and strain AE01 from the dorsal surface of a hydrothermal vent tubeworm. 16S rRNA analysis reveals that these isolates are part of a tight phylogenetic cluster with previously characterized members of the genus Aurantimonas. Other organisms within this clade have been isolated from disparate environments such as surface waters of the Arctic and Mediterranean seas, a deep-sea hydrothermal plume, and a Caribbean coral. Further analysis of all these strains revealed that many of them are capable of oxidizing dissolved Mn(II) and producing particulate Mn(III/IV) oxides. Strains SI85-9A1 and HTCC 2156 were characterized further. Despite sharing nearly identical 16S rRNA gene sequences with the previously described Aurantimonas coralicida, whole genome DNA-DNA hybridization indicated that their overall genomic similarity is low. Polyphasic phenotype characterization further supported distinguishing characteristics among these bacteria. Thus SI85-9A1 and HTCC 2156 are described as two new species within the family ‘Aurantimonadaceae’: Aurantimonas manganoxydans sp. nov. and Aurantimonas litoralis sp. nov. This clade of bacteria is widely distributed around the globe and may be important contributors to Mn cycling in many environments. Our results highlight the difficulty in utilizing 16S rRNA-based approaches to investigate the microbial ecology of Mn(II) oxidation.

中文翻译:

Aurantimonas manganoxydans,sp。十一月 和Aurantimonas litoralis,sp。十一月:来自根瘤菌目的α-变形菌的全球分布分支的Mn(II)氧化代表

从非常不同的海洋环境中分离出几种密切相关的 Mn(II) 氧化 α-变形菌:来自加拿大分层峡湾的好氧/缺氧界面的菌株 SI85-9A1、来自俄勒冈海岸外地表水域的菌株 HTCC 2156 和菌株来自热液喷口管虫背面的 AE01。16S rRNA 分析表明,这些分离株是一个紧密的系统发育簇的一部分,具有先前表征的橙皮单胞菌属成员。该分支内的其他生物已从不同的环境中分离出来,例如北极和地中海的地表水、深海热液羽流和加勒比珊瑚。对所有这些菌株的进一步分析表明,它们中的许多能够氧化溶解的 Mn(II) 并产生颗粒状 Mn(III/IV) 氧化物。菌株 SI85-9A1 和 HTCC 2156 被进一步表征。尽管与先前描述的珊瑚橙单胞菌共享几乎相同的 16S rRNA 基因序列,但全基因组 DNA-DNA 杂交表明它们的整体基因组相似性较低。多相表型特征进一步支持区分这些细菌的特征。因此,SI85-9A1 和 HTCC 2156 被描述为“橙单胞菌科”中的两个新物种:橙单胞菌属 manganoxydans sp。十一月 和 Aurantimonas litoralis sp。十一月 这种细菌分支广泛分布于全球,可能是许多环境中锰循环的重要贡献者。我们的结果强调了利用基于 16S rRNA 的方法来研究 Mn(II) 氧化的微生物生态学的困难。尽管与先前描述的珊瑚橙单胞菌共享几乎相同的 16S rRNA 基因序列,但全基因组 DNA-DNA 杂交表明它们的整体基因组相似性较低。多相表型特征进一步支持区分这些细菌的特征。因此,SI85-9A1 和 HTCC 2156 被描述为“橙单胞菌科”中的两个新物种:Aurantimonas manganoxydans sp。十一月 和 Aurantimonas litoralis sp。十一月 这种细菌分支广泛分布于全球,可能是许多环境中锰循环的重要贡献者。我们的结果强调了利用基于 16S rRNA 的方法来研究 Mn(II) 氧化的微生物生态学的困难。尽管与先前描述的珊瑚橙单胞菌共享几乎相同的 16S rRNA 基因序列,但全基因组 DNA-DNA 杂交表明它们的整体基因组相似性较低。多相表型特征进一步支持区分这些细菌的特征。因此,SI85-9A1 和 HTCC 2156 被描述为“橙单胞菌科”中的两个新物种:橙单胞菌属 manganoxydans sp。十一月 和 Aurantimonas litoralis sp。十一月 这种细菌分支广泛分布于全球,可能是许多环境中锰循环的重要贡献者。我们的结果强调了利用基于 16S rRNA 的方法来研究 Mn(II) 氧化的微生物生态学的困难。全基因组 DNA-DNA 杂交表明它们的整体基因组相似性较低。多相表型特征进一步支持区分这些细菌的特征。因此,SI85-9A1 和 HTCC 2156 被描述为“橙单胞菌科”中的两个新物种:橙单胞菌属 manganoxydans sp。十一月 和 Aurantimonas litoralis sp。十一月 这种细菌分支广泛分布于全球,可能是许多环境中锰循环的重要贡献者。我们的结果强调了利用基于 16S rRNA 的方法来研究 Mn(II) 氧化的微生物生态学的困难。全基因组 DNA-DNA 杂交表明它们的整体基因组相似性较低。多相表型特征进一步支持区分这些细菌的特征。因此,SI85-9A1 和 HTCC 2156 被描述为“橙单胞菌科”中的两个新物种:橙单胞菌属 manganoxydans sp。十一月 和 Aurantimonas litoralis sp。十一月 这种细菌分支广泛分布于全球,可能是许多环境中锰循环的重要贡献者。我们的结果强调了利用基于 16S rRNA 的方法来研究 Mn(II) 氧化的微生物生态学的困难。因此,SI85-9A1 和 HTCC 2156 被描述为“橙单胞菌科”中的两个新物种:橙单胞菌属 manganoxydans sp。十一月 和 Aurantimonas litoralis sp。十一月 这种细菌分支广泛分布于全球,可能是许多环境中锰循环的重要贡献者。我们的结果强调了利用基于 16S rRNA 的方法来研究 Mn(II) 氧化的微生物生态学的困难。因此,SI85-9A1 和 HTCC 2156 被描述为“橙单胞菌科”中的两个新物种:橙单胞菌属 manganoxydans sp。十一月 和 Aurantimonas litoralis sp。十一月 这种细菌分支广泛分布于全球,可能是许多环境中锰循环的重要贡献者。我们的结果强调了利用基于 16S rRNA 的方法来研究 Mn(II) 氧化的微生物生态学的困难。
更新日期:2009-03-13
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