单细胞SCI热点+癌型万能组合思路火热预定中

1、结直肠癌TME细胞中m6A甲基化调控因子landscape

图A: 研究整体设计示意图

图B：研究涉及单细胞数据TME细胞类型t-SNE可视化

图C：细胞通讯分析显示结直肠癌的TME细胞之间存在相互作用

图D：结合不同的临床因素展示m6A因子在不同分组中的表达水平

图E：6种TME细胞中m6A因子表达热图

图F：每个样本中m6A因子对每种TME免疫细胞NMF聚类细分亚群的比例展示图

2、m6A甲基化调控因子介导的成纤维细胞亚群

图A: 伪时序分析分析展示了m6A因子在亚群轨迹中发挥重要作用(以成纤维细胞亚群为例)

图B：4种不同m6A因子主导的成纤维细胞亚群与上皮细胞间的细胞通讯（有不同数量的受-配体对）

图C：肿瘤和正常中成纤维细胞亚群比例展示(WTAP + CAF-C2显著差异；ps: WTAP是m6A因子之一)

图D：WTAP + CAF-C2亚群通路富集分析

图E：成纤维细胞亚群与pan-CAF signature相关性分析(WTAP + CAF-C2与炎性CAF相关)

图F：成纤维细胞亚群TF活性差异(一些TF在WTAP + CAF-C2显著上调)

图G：成纤维细胞亚群中致癌通路基因表达展示（WTAP + CAF-C2和NoneMethy-CAF-C4显著不同）

图H：成纤维细胞亚群中REACTOME 通路基因富集

3、m6A甲基化调控因子介导的巨噬细胞亚群与经典分型特征相似

图A: 5种m6A因子主导的巨噬细胞亚群与上皮细胞间的细胞通讯（有不同数量的受-配体对）

图BC：WTAP+mac-C1与促炎性巨噬细胞显著相关，HNRNPA2B1+mac-C3与SPP1+、C1q+巨噬细胞显著相关

图D：5种巨噬细胞亚群TF活性差异(WTAP + mac-C1 、HNRNPA2B1 + mac-C3存在显著差异)

图E：5种巨噬细胞亚群代谢过程活性有显著差异

图F：WTAP+mac-C1、HNRNPA2B1+mac-C3和TTHDC1 & YTHDF3+mac-C4巨噬细胞亚群有不同的REACTOME 通路富集

4、m6A甲基化调控因子介导的T/B细胞亚群表型阐明CRC中的抗肿瘤免疫反应

图AB:  8种类型的Tcell t-SNE可视化（A）以及比例图（B）；

图C：5种不同m6A因子主导的T细胞亚群与上皮细胞间的细胞通讯（有不同数量的受-配体对）

图D：T细胞亚群有不同TF活性

图E：T细胞亚群有不同的T细胞功能signature差异（T exhaustion score, T cytotoxic score, T efector score, T evasion score）；此外展示了T细胞亚群在免疫刺激因子，抑制因子和T细胞功能标记基因的表达差异

图F：在3种类型B细胞中不同m6A因子主导的B细胞亚群的数量和比例没有差异

图H：4种不同m6A因子主导的B细胞亚群与上皮细胞间的细胞通讯（受-配体对数量相似）

图I：不同m6A因子主导B细胞亚群有不同TF活性

5、m6A甲基化调控因子介导的TME模式有助于CRC预后和免疫治疗反应预测

提取了不同m6A因子主导的TME细胞亚群的差异基因，基于GSVA和结直肠癌队列（11cohort）和免疫治疗队列（13cohort）表达谱计算了不同的m6A亚群评分，并评估了他们在单独和meta数据集中的预后价值以及对免疫治疗的反应预测价值

图A: 11个CRC队列RFS预后价值（不同m6A亚群评分有显著差异）

图B：11个CRC队列OS预后价值（不同m6A亚群评分有显著差异）

图C：13个免疫治疗队列m6A亚群评分的反应率（不同m6A亚群评分有显著差异）

6、m6A甲基化调控因子介导的TME模式加强了细胞间通讯

图A:  细胞通讯分析识别到了m6A TME细胞亚群到肿瘤上皮细胞间关键的受-配体对

图B：m6A TME亚群影响细胞通讯的机制假设