【Nature】微生物古DNA恢复技术揭秘14世纪黑死病起源地

从书中得到的启示

来自斯特林大学的Philip Slavin教授是该研究小组的成员之一。长期以来，他对“黑死病”的研究颇感兴趣，偶然间，他从一本1890年的著作中发现了一条十分有趣的线索——根据该著作描述，在如今的吉尔吉斯斯坦北部地区，有着一个古代墓葬遗址；在1338年至1339年间，此地埋葬的死者人数骤增，在一些逝者的墓碑上写着“死于瘟疫”。1338年至1339年！对于了解黑死病的任何人来说，都是一个敏感的年份——仅仅早于黑死病在欧洲爆发的时间（1347年）8年！这个信息激发了Slavin教授浓厚的兴趣。黑死病被学界认为和一次“大爆发（Big Bang）”事件有关，该“大爆炸”事件是指当时由啮齿动物和跳蚤所携带的鼠疫株群突然多样化“爆发”。但是，对于这次“大爆发”所发生的具体时间，科学家们一直无法确定，一般认为可能早在10世纪就已发生过此“大爆炸”。1338年至1339年此地的死亡人数骤增、鼠疫株群“大爆发”以及黑死病的地理来源之间，会有怎样的联系呢？

微生物古DNA恢复技术——穿越时空的对话

根据考古资料及历史记载，该国际研究小组调查了位于如今吉尔吉斯斯坦伊塞克湖（Lake Issyk-Kul）附近Chüy山谷的Kara-Djigach和Burana墓地。根据该两个墓区的墓碑铭文记载，1338年至1339年间出现了大量墓葬，甚至其中一些铭文明确地记载了逝者的死亡原因——不明原因的瘟疫。为了更好地了解Kara-Djigach和Burana地区的综合背景，研究小组还翻译并分析了两地区考古发掘过程中幸存下来的档案信息。此外，研究人员还从7位古代人类遗骸个体（5位来自Kara-Djigach，2位来自Burana）身上通过杂交捕获（hybridization capture）方式，抓取了人类基因数据——约124万个祖先信息单核苷酸多态性（ancestry-informative single-nucleotide polymorphisms）。其中，4位个体拥有足够的基因组覆盖率，可以对其进行群体遗传分析。采用主成分分析和祖先建模（ancestry modelling），研究者发现这些古代遗骸个体泛属于（falling broadly within）欧亚大陆中部古代和当今人口的变化性（variability）。然而，由于缺乏来自该区域的同期人类基因组数据，该群体性遗传分析的精确性还有待证明。该项研究由德国图宾根大学（Eberhard Karls University of Tübingen）、马克斯·普朗克进化人类学研究所（Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology）等机构的研究人员于6月15日发表在Nature杂志上。