产胶蒲公英和普通蒲公英参考基因组比较取得重要研究进展
产胶蒲公英（又称橡胶草或青胶蒲公英，Taraxacum kok-saghyz, TKS）和普通蒲公英（Taraxacum mongolicum, TM）分别是蒲公英属中重要的产橡胶植物与药用植物，可广泛种植于世界各地。橡胶草根部可合成高达20%的天然橡胶和40%的菊糖，因此橡胶草被认为是除巴西橡胶树之外，最有可能成为替代生产天然橡胶的重要经济作物和科学研究的经典模式植物。普通蒲公英中叶片和根富含蒲公英甾醇等萜类物质和菊糖，可应用于传统中医治疗和动物饲料等，具有重要的药用价值。
橡胶草与普通蒲公英分别有16条与24条染色体。2018年中科院遗传与发育生物学研究所李家洋课题组与合作者率先完成了橡胶草基因组草图，为橡胶草基因克隆等遗传学和基础生物学研究提供了重要的基因组序列信息支撑。
近期，李家洋课题组与合作者进一步完成了橡胶草与普通蒲公英的高质量参考基因组组装，并进行了橡胶草和普通蒲公英之间的比较基因组学分析。研究人员利用最新测序和组装技术对橡胶草基因组进行了更加精细的组装，同时解析了世界上首个高质量的普通蒲公英参考基因组。升级后的基因组在准确性和完整度等方面具有明显的提高，可作为高质量的参考基因组应用于科学研究。该研究成果以“Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum”为题，于近日在线发表在权威学术期刊SCIENCE CHINA Life Sciences杂志上。
产胶蒲公英(TK1151)和普通蒲公英(TM5)的表型及基因组共线性分析
比较基因组学分析发现，橡胶草和普通蒲公英基因组之间存在大量遗传变异，以及基因表达和基因家族的差异变化，可能是物种形成和进化的重要原因。通过对产胶植物橡胶草与非产胶植物普通蒲公英的天然橡胶合成途径比较分析，发现在橡胶草中对橡胶合成起到关键作用的小橡胶粒子蛋白（Small rubber particle protein，SRPP）和顺式异戊二烯基转移酶（cis-Prenyltransferase，CPT）的基因家族经历了明显的扩张现象。同时，该研究还鉴定比较了蒲公英甾醇合成途径。这一系列研究结果不仅可以为橡胶草中天然橡胶合成和普通蒲公英中药用成分科学研究提供基因组和遗传资源，还可以为橡胶草和普通蒲公英的分子改良育种提供科学的理论指导。