植物单cell N50 143kb！希望组Super Ultra Long硬核实力，您还等什么？
继8月底宣布单Cell reads N50突破100Kb后，希望组ONT Ultra-long测序再传捷报，某单子叶植物超长测序数据产出超过1200Gb，平均读长N50达51.9Kb，单cell最高产出58.9Gb,最长reads N50达143.3Kb！这标志着希望组ONT Ultra-long测序已经能够稳定产出高质量的超长片段！
某单子叶植物ONT Ultra-long测序单Cell产量超过10G，Reads N50达143.3Kb，长度100Kb以上的reads占总数据量的65.3%，长度200Kb以上的reads占总数据量的28.1%！
图2 某单子叶植物单Cell 超长测序读长分布
希望组自2017年推出ONT超长测序服务以来，现已完成昆虫、两栖动物、鱼类、鸟类、哺乳动物、多倍体植物、药用植物等数百个物种的ONT Ultra-long测序工作，并且多个物种测序单Cell read N50突破100Kb!
牛津纳米孔测序平台独有的Ultra-long测序能够产生超长测序片段，轻松跨越基因组中连续重复或大片段重复区域，更大限度地还原真实的基因组景观。
对于基因组中“暗区”，二代测序小短腿直接掉入深渊，三代测序小心翼翼能够跨过，而Ultra-Long Reads能够轻松跨越连续重复区域，提供更多的序列信息，更便于组装过程重复片段划分。
显著提升组装质量
在基因组组装过程中可以通过增加读长获得理想组装质量[1]，加入Ultra-Long Reads数据可以显著提升人类基因组组装效果，填补基因组中的缺口，甚至组装出端粒到端粒水平的完整染色体[2]。
节约组装成本
相同测序深度下采用Ultra-Long的建库测序方法，产生用于组装超大型基因组的read数更少，降低了组装复杂度，减少了计算资源的使用，能够节省一定的组装成本。
Nanopore Ultra-long 超长读长的 Reads N50 相比 Normal long 有成倍的提升，在基因组组装过程中加入适量 Ultra-long 数据，可有效提升基因组组装质量。高杂合、高重复基因组采用纯 Ultra-long 数据进行基因组组装，能够达到较好的组装质量。
希望组ONT Ultra-Long组装案例
希望组三代测序组装采用PromethION 48+Ultra-long+Next系列组装软件+Bionano&Hi-C的最新策略，结合华为云将纳米孔测序数据分析流程整合到云计算平台上，实现急速基因组组装与注释，为全球客户提供快速、高效的纳米孔长读长测序计算和存储服务！希望组三代测序，技术顶尖，算法领先，服务全面，为您的科研之路保驾护航！
[1] Henson J, Tischler G, Ning Z. Next-generationsequencing and large genome assemblies[J]. Pharmacogenomics, 2012, 13(8):901-915.
[2] Jain M, Koren S, Miga K H, et al. Nanoporesequencing and assembly of a human genome with ultra-long reads[J]. NatureBiotechnology, 2018, 36(4).
END
精彩回顾：
希望组自主三代组装软件NextDenovo最新版本全球学术开源！
Nextomics 硬核：ONT超长单Cell Reads N50突破100Kb！基因组测序“5G”时代来临！
ONT Ultra Long与“Telomre to Telomere”的风云际会：首个人类X染色体完成图与甲基化图谱发布