中科普瑞-限时推出（3500/样本）850k芯片服务
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干货 | 靠谱 | 实用
Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip（850K甲基化芯片）服务
助力科研，畅“研”一夏
3500 RMB/样本
一个样本起！
中科普瑞850K芯片服务 3500 RMB豪华套餐 | ||
实验服务（含） | 芯片实验（*不含样本抽提） | |
基础分析（含） | 数据质控 | 1. 样本的β值密度曲线 |
2. 各样本的β值箱线图 | ||
3. 样本相关性图 | ||
4. PCA图 | ||
差异筛选 | 1. 标准化后的甲基化位点总表 | |
2. 差异甲基化位点（DMP）列表 | ||
3. 差异甲基化区域（DMR）列表 | ||
4. 差异甲基化位点的染色体分布图 | ||
5. 差异甲基化位点热图/散点图/火山图 | ||
功能注释 | 1. DMP对应基因的GO和KEGG富集 | |
2. DMR对应基因的GO和KEGG富集 | ||
高级分析（含） | 1. Functional Epigenetic Modules分析 | |
2. 拷贝数变异分析 | ||
3. 甲基化与表达谱的关联分析（有对应表达谱数据） | ||
高级分析 （收费项目，不含） | 1. 多组学关联分析 2. WGCNA分析 3. EWAS分析 4. 机器学习 5. Meta分析 6. 其它可定制高级分析 | |
部分高级分析展示
850k芯片技术特点
1. 全面的基因组覆盖范围：检测>853,000个CpG位点，全面覆盖CpG岛、启动子、编码区、开放染色质和增强子。此外还包括CpG岛外的CpG位点，已知DMR位点，脱氧核糖核酸酶超敏位点以及miRNA启动子区域;
2. 高质量的数据：同时采用Infinium I及II探针设计，使检测范围最大化;
3. 分辨率高：单碱基分辨率，可以直接检测到发生甲基化的确切位点;
4. 重复性高： 自身技术重复相关性R2 > 0.98 ；与450K交集探针间（850K vs 450K）相关性R2 > 0.98;
5. 起始模板量低：仅需 250 ng，大大节约了样品量;
6. 检测样本类型更广：不仅可以检测全血、细胞、新鲜/新鲜冷冻的组织、而且也可检测FFPE样本。
850K芯片与WGBS参数对比
技术参数 | 850K芯片 | WGBS |
检测物种 | 人 | 不受限 |
检测原理 | 重亚硫酸盐转化 | 重亚硫酸盐转化 |
起始量 | 250 ng | 2 μg |
分辨率 | 单碱基 | 单碱基 |
检测CpG位点 | >850000 | >3,800,000 |
是否适用于FFPE | 适用 | 不适用 |
技术重复 | R2>0.98 | 低 |
实验周期 | 20个工作日 | 30个工作日 |
实验费用 | 3.5K | 10K |
检测范围 | 已知位点 | 不受限 |
数据分析 | 简单 | 困难 |
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