剪接因子对RNA剪接的调控至关重要，但一些剪接因子也被认为参与了转录调控。它们在转录过程中的参与机制尚不明确。
2024年4月19日，武汉大学肖锐团队在Genome Biology 在线发表题为“RBM22 regulates RNA polymerase II 5′ pausing, elongation rate, and termination by coordinating 7SK-P-TEFb complex and SPT5”的研究论文，该研究描述了剪接因子RBM22在协调人类细胞中RNA聚合酶II（RNAPII）转录的多个步骤中的直接作用。
RBM22蛋白广泛地位于细胞核中RNAPII转录的基因位点上。RBM22的丧失促进了RNAPII的暂停释放，降低了延伸速率，并诱导了全基因组范围内的转录读过程，伴随着产生包含基因下游序列的转录本。RBM22优先结合于过磷酸化、转录活跃的RNAPII，并通过调节7SK-P-TEFb复合物的稳态和RNAPII与SPT5在染色质水平上的结合来协调其动态过程。
转录是基因表达的关键调控阶段。RNA聚合酶II（RNAPII）介导的转录包括RNAPII的启动子招募、启动、启动子近端暂停、延伸和终止等步骤，每一步都受到高度调控。与其他因子一起，DRB敏感性诱导因子（DSIF）由SPT5和SPT4组成，以及负性延伸因子（NELF）复合物建立RNAPII的暂停状态，而这种暂停的RNAPII可以被P-TEFb复合物释放，其CDK9亚基磷酸化DSIF、NELF以及RNAPII CTD的Ser2残基，以促进产物的延伸。或者，P-TEFb可以被固定在一个与7SK非编码RNA和抑制蛋白HEXIM1、LARP7和MePCE相关的7SK小核糖核蛋白（snRNP）相关的P-TEFb（7SK-P-TEFb）复合物中。CDK9介导的磷酸化导致NELF从转录机器中解离，而SPT5仍然伴随着RNAPII的延伸，维持延伸速度和高效的终止。在转录末端，CPSF介导的前体RNA的剪切和多腺苷酸化引发大多数编码蛋白基因和长非编码RNA基因的RNAPII终止，导致RNAPII在哺乳动物细胞的聚腺苷酸（polyA）位点下游几千个碱基处解除连接。剪接因子在成熟mRNA从细胞核导出到细胞质之前促进前体mRNA转录本的剪接起着至关重要的作用。然而，最近的研究揭示了剪接因子在转录周期中的各种新兴作用。例如，SRSF2促进RNAPII暂停释放；RBM25介导转录因子YY1在染色质结合、DNA环路和转录中的功能；RBMFOX2在转录和双价基因的polycomb复合物2（PRC2）之间协调。有趣的是，剪接体组分还可以参与转录调控。例如，U1 snRNP可以防止延伸过程中的过早终止，而U2 snRNP在基因起始处需要RNAPII暂停释放和延伸速度。这些发现使我们更好地理解了剪接机制组分之间的重叠功能。![]()
模式机理图（图片源自Genome Biology ）RBM22是NTR（NineTeen Related）复合物的组分，主要维持剪接体的催化核心的构象。在从重塑B复合物到激活的B复合物的过程中，RBM22进入复合物并接触U2 snRNP以保持其处于打开的构象并稳定U6 snRNA的下游序列。它作为催化核心和剪接体的其他重要蛋白组分之间的桥梁，从而参与前体mRNA的剪接。RBM22的失调与细胞存活和癌症进展密切相关。作者之前的工作已经揭示了许多RNA结合蛋白（RBPs）的染色质结合活性，包括RBM22。为了进一步研究RBM22在剪接之外是否具有额外的功能，作者利用了几种顶尖的下一代测序（NGS）方法来分析其在转录的多个调节阶段中的功能。结果表明，RBM22在控制转录延伸动力学和终止中起着直接作用，从而调节基因表达。https://doi.org/10.1186/s13059-024-03242-6![]()
—END—
内容为【iNature】公众号原创，
转载请写明来源于【iNature】
微信加群
iNature汇集了4万名生命科学的研究人员及医生。我们组建了80个综合群（16个PI群及64个博士群），同时更具专业专门组建了相关专业群（植物，免疫，细胞，微生物，基因编辑，神经，化学，物理，心血管，肿瘤等群）。温馨提示：进群请备注一下（格式如学校+专业+姓名，如果是PI/教授，请注明是PI/教授，否则就直接默认为在读博士，谢谢）。可以先加小编微信号（love_iNature），或者是长按二维码，添加小编，之后再进相关的群，非诚勿扰。
![]()
![]()
投稿、合作、转载授权事宜
请联系微信ID：13701829856 或邮箱：iNature2020@163.com
觉得本文好看，请点这里！