2021-2024年 在中心攻读硕士

《基于龙稻345/龙稻18重组自交系群体的稻米品质性状QTL分析》

在学期间发表论文 

（1）侯本福, 姜树坤, 杨传铭, 杨贤莉, 王立志, 刘凯. 禾本科植物盐腺的结构和功能研究进展. 黑龙江农业科学, 2022, (08):74-78.

（2）侯本福, 杨传铭, 张喜娟, 杨贤莉, 王立志, 王嘉宇, 李红宇(通讯作者), 姜树坤(通讯作者). 利用龙稻5号/中优早8号RIL群体定位粒形QTL. 中国水稻科学, 2024, 38(01):13-24.

（3）侯本福，杨传铭，张喜娟，杨贤莉，王立志，王嘉宇，李红宇（通讯作者），姜树坤（通讯作者）.利用龙稻5号/中优早8号RIL群体定位粒形QTL，中国水稻科学，2024，38（01）：13-24

（4）Xijuan Zhang, Kai Liu, Chuanming Yang, Benfu Hou, Xianli Yang, Lizhi Wang, Shize Cui, Yongcai Lai, Zhugang Li（通讯作者）, and Shukun Jiang（通讯作者） (2024) . Detection of Quantitative Trait Loci Associated with Alkaline Tolerance Using Recombinant Inbred Line Population Derived from Longdao5 × Zhongyouzao8 at Seedling Stage. Life, 14, 1151

毕业论文摘要

品质是决定稻米商品价值的重要指标之一。本研究旨在利用水稻重组自交系群体鉴定控制稻米品质相关性状的QTL，为水稻品质相关基因的挖掘和高品质粳稻育种应用奠定基础。以优质粳稻龙稻18（LD18）为父本和高产粳稻龙稻345（LD345）为母本构建包含131个家系的重组自交系群体，利用重测序技术对RIL群体开发高密度SNP，绘制连锁图谱，测定稻米外观品质、加工品质、蒸煮食味品质和营养品质等品质相关性状，分析品质性状间的关系并进行QTL定位。主要研究结果如下：

1. 利用重测序技术对原始测序序列过滤，亲本LD18得到16.89 Gbp的clean data，亲本LD345得到20.30 Gbp的clean data。适用于RIL且深度不低于4X的SNP标记233214个，根据子代重组情况将SNP划分，得到2218个Bin。利用2218个Bin鉴定重组自交系群体共131个家系的基因型，将Bin分为12个连锁群，分析连锁群内Marker的线性排列，构建遗传图谱，得到总图距为1004.76 cM，平均图距0.45cM的遗传连锁图谱。

2. 利用区间作图法对RIL群体进行QTL定位，共检测到27个水稻品质相关QTL。包括16个外观品质QTL、4个加工品质QTL、5个蒸煮食味品质QTL和2个营养品质QTL，分布在除11和12号染色体的其他10条染色体上。其中外观品质QTL有16个，分布在2、5、6、7、9和10号染色体上，表型贡献率范围为2.70%-58.14%，LOD值范围为3.28-38.01。包括7个粒长QTL（qGL2a、qGL2b、qGL5、qGL6、qGL7、qGL9和qGL10）、3个粒宽QTL（qGW2、qGW3和qGW5）、4个粒长宽比QTL（qGLW1a、qGLW2、qGLW5a和qGLW5b）、1个垩白率QTL（qDEC5）和1个垩白粒率QTL（qPGWC5）。加工品质QTL有4个，分布在4、7和8号染色体上，表型贡献率范围为9.98% – 14.01%，LOD值范围为3.01 – 4.88。包括2个糙米率QTL（qBR4和qBR7）和2个精米率QTL（qMR7和qMR8）。蒸煮食味品质QTL有5个，分布在5、7、8和10号染色体上，表型贡献率范围为10.10%-17.25%，LOD值范围为3.68 – 6.02。包括3个食味值QTL（qTV5、qTV8和qTV10）和2个直链淀粉QTL（qAC7和qAC8）。营养品质QTL有2个，为2个蛋白质含量QTL（qPC7和qPC8），分布在7和8号染色体上，表型贡献率范围为8.61% – 20.68%，LOD值范围为3.36 – 7.17。

3. 使用多环境联合分析对RIL群体进行QTL定位，共检测到31个水稻品质相关QTL。包括24个外观品质QTL、2个加工品质QTL、4个蒸煮食味品质QTL和1个营养品质QTL，分布在除12号染色体的其他11条染色体上。其中外观品质QTL有24个，分布在1、2、5、6、7、9、10号和11号染色体上，表型贡献率范围为1.69% – 60.53%，LOD值范围为4.48 – 95.20。包括9个粒长QTL（qGL1、qGL2a、qGL2b、qGL5、qGL6、qGL7、qGL9、qGL10和qGL11）、5个粒宽QTL（qGW2、qGW3、qGW5、qGW6和qGW8）、6个粒长宽比QTL（qGLW1a、qGLW1b、qGLW2、qGLW5a、qGLW5b和qGLW9）、1个垩白率QTL（qDEC5）和3个垩白粒率QTL（qPGWC1、qPGWC5和qPGWC11）。加工品质QTL有2个，分布在6和7号染色体上，表型贡献率范围为2.03% – 31.70%，LOD值均为5.01。分别为糙米率QTL qBR6和精米率QTL qMR7。蒸煮食味品质QTL有4个，分布在5、8和10号染色体上，表型表型贡献率范围为14.89% – 26.52%，LOD值范围为4.67-7.26。包括3个食味值QTL（qTV5、qTV8和qTV10）和1个直链淀粉QTL（qAC8）。营养品质QTL有1个，为蛋白质含量QTL qPC8，表型贡献率为30.98%，LOD值为7.45。

4. 定位到的36个稻米品质QTL中， qGL7、qGL9、qGL10、qGL11、qGW3、qGW6、qGLW1a、qGLW1b、qGLW2、qGLW5b、qGLW9、qPGWC1和qPGWC11等13个可能为新发现水稻外观品质相关QTL；qBR4、qBR6、qBR7/qMR7和qMR8共4个可能为新发现水稻加工品质相关QTL；qTV5、qTV8、qTV10和qAC8/qPC8共4个可能为新发现水稻蒸煮食味品质和营养相关QTL。