低温冷害是影响水稻生长发育，进而造成不同程度减产的主要气象灾害之一。挖掘鉴定耐冷基因，选育耐冷品种，是解决水稻低温冷害最简单、直接和有效的手段之一。杨传铭等利用丽江新团黑谷/沈农265 衍生的包含144 个株系的重组自交系群体，通过人工气候室进行苗期耐冷性鉴定。结合全基因组重测序构建的包含2828 个bin 标记的高密度遗传图谱，进行苗期耐冷性QTL 定位和互作分析。共检测到4 个苗期耐冷QTL，分别定位于水稻的1、8、10 和12 号染色体上，单个QTL 的表型贡献率为5.33%～19.86%。其中，qCTS1、qCTS10 和qCTS12 的增效等位基因来源于强耐冷亲本丽江新团黑谷，qCTS8 的增效等位基因来源于沈农265。主效QTL qCTS12 定位在12 号染色体的15.98 Mb－16.37 Mb 之间，物理图谱区间为396.67 Kb。qCTS1 定位在1 号染色体的9.20 Mb－9.50 Mb 间，物理图谱区间为299.85 kb。qCTS8 定位在8号染色体的26.09 Mb－26.15 Mb 之间，物理图谱区间为55.05 Kb。qCTS10 定位在10 号染色体的11.13 Mb－11.21 Mb 间，物理图谱区间为85.82 kb。进一步分析发现，除qCTS1-qCTS8 之间存在负向互作外，其余QTL 间的互作表现为加性效应。这些研究可为耐冷分子设计育种提供有用的基因资源，同时为阐明水稻苗期耐冷的遗传和分子机制提供参考。