2025年5月24号和26号，课题组先后举行2两场硕、博士学位论文答辩会，答辩会邀请了南京中医药大学顾万君教授、南京农业大学张定东教授、东南大学杨芳教授、东南大学卢青教授、东南大学王进科教授、东南大学孙清江教授，东南大学青钊教授、中大医院李函主任、东南大学毕昆博士等组成答辩委员会。博士生刘芝余、硕士生付洪雯、朴妍妍等三名同学顺利通过学位论文的答辩。

刘芝余同学的博上论文系统优化了m6A甲基化高通量测序检测的关键参数，验证了Millpore抗体、500ng RNA输入量及2小时内样本处理的可靠性，为m6A甲基化检测提供了标准化的实验方案参考。同时，利用优化的实验方案 对FTO基因敲除小鼠多种组织器官的m6A甲基化进行了高通量测序分析，提 示了 FTO介导的组织特异性m6A去甲基化可能的模式，尤其对心脏组织的独 特上调效应，为解析FTO在代谢疾病、器官发育中的作用机制提供了一定的理 论依据。

付洪雯同学的硕士论文对肝细胞癌循环RNA(cfRNA)表达谱数据，从基因及细胞层面验证了cfRNA在肿瘤检测中的应用潜力。通过对肝细胞癌及对照组数据进行差异表达分析，筛选出潜在的特异性生物标志物及片段组学特征；采用XGBoost算法结合贝叶斯优化和五折交叉验证方法，开发了基于cfRNA表达谱、片段谱及多组学联合的肝细胞癌诊断模型。研究结果为肝细胞癌的临床应用研究提供了一定的参考。

朴妍妍同学的硕士学位论文针对淡水湖泊生态健康问题，通过宏基因组和宏转录组测序，探究太湖富营养化时期微生物群落的组成结构及对环境变化的响应。该论文选题具有较重要的理论意义，其主要发现太湖微生物群落组成和基因表达谱随季节和采样地点呈规律性变化，夏季蓝藻门最为优势，秋季变形菌门爆发，冬季各群落比例均降低。转录相关蛋白Sigma70_r2和信号转导元件TPR等在季节变化前提前激活，冬季微管蛋白和细胞骨架蛋白表达显著上调，表明微生物群落可以通过调控不同功能蛋白的表达来适应季节变化。

本次系列答辩会的成功举行，标志着刘芝余、付洪雯、朴妍妍三位同学在生物医学工程、生物信息及环境微生物等领域掌握了扎实的基础理论知识，取得了重要的研究成果，具备独立从事相关科学研究工作的能力，其研究工作很好的达到了相应学位论文及毕业的要求。答辩委员会同意建议授予其相应的工学博士、电子信息硕士学位。

在此，我们向刘芝余博士、付洪雯硕士、朴妍妍硕士表示最热烈的祝贺！