在黄进课题组每周的文献分享组会上由冉璐妮分享文献,该文章发表于Microbiome(中科院一区Top,IF=12.7,第一作者:Hong-Mei Jia、Jie Zhou,通讯作者:Dong-Mei He、Zhu-Yun Yan)。

一、研究背景:气候变化下的丹参生存挑战与微生物的潜在价值
全球变暖引发的干旱与高温胁迫,正成为制约植物生长的主要环境压力,尤其对药用植物丹参(Salvia miltiorrhiza)影响显著,严重影响其临床应用价值。
在自然环境中,植物与微生物的互作是抵御逆境的重要策略。微生物可通过提高叶绿素含量、促进养分吸收、积累渗透保护物质等方式帮助植物缓解胁迫,但丹参根际微生物群落如何响应干旱高温胁迫,以及驱动这些变化的潜在机制仍不明确。此外,植物通过根系分泌物调控微生物群落的过程(如招募有益二菌群)是抗逆的关键,但药用植物在此过程中的具体代谢调控机制长期被忽视。
为此,该研究提出假设:胁迫下丹参会通过关键根系分泌物招募特定微生物增强抗逆性,并通过多组学技术与验证实验揭示这一机制。
二、研究结果:微生物驱动的丹参抗逆机制
1. 微生物显著缓解丹参的胁迫损伤
实验对比了对照组(CK)、高温(T)、干旱(D)、干旱高温复合胁迫(TD)下丹参的生理指标,发现微生物接种能显著提高干旱胁迫下丹参的鲜重、叶片含水量及叶绿素含量,同时促进氮、磷吸收,减少膜损伤标志物 MDA 的积累。并且微生物还能特异性促进丹参活性成分积累,如干旱胁迫下接种组的丹参酮类成分含量显著升高,印证了微生物对丹参的双重提升作用。
2. 细菌对胁迫更敏感,类芽孢杆菌是关键抗逆菌群
通过微生物组学方法测序发现,细菌对气候胁迫的响应比真菌更显著:干旱(D)和复合胁迫(TD)下,根际类芽孢杆菌(Paenibacillus)的相对丰度显著升高,而高温(T)下链霉菌(Streptomyces)富集。再由合成群落(SynCom)实验验证,由 5 种类芽孢杆菌组成的 SynCom SM1 能显著提高干旱胁迫下丹参的生物量和活性成分含量,而链霉菌组成的 SynCom SM2 在高温下效果不佳,进一步证实类芽孢杆菌是干旱胁迫的核心有益菌。
3. β- 榄香酮酸:介导类芽孢杆菌富集的关键代谢物
非靶向代谢组学分析发现,干旱胁迫下丹参根系分泌的 β- 榄香酮酸(β-elemonic acid)是驱动类芽孢杆菌富集的 “信号分子”:通过外源施加 β- 榄香酮酸后观察到干旱组的类芽孢杆菌绝对丰度显著高于其他组,且丹参生物量在类芽孢杆菌存在时显著增加。这一过程形成 “丹参分泌 β- 榄香酮酸→类芽孢杆菌富集→增强丹参抗旱性” 的闭环,揭示了植物-微生物互作的特异性分子机制。
三、对课题组的启发
该研究整合了16S rRNA/ITS测序、代谢组学、合成群落验证等技术,清晰解析了“微生物群落变化-关键代谢物-植物表型”的关联,不仅揭示了丹参的抗逆智慧,更为植物-微生物互作领域提供了从 “现象观察”到“机制解析”的完整研究框架。目前,对可募集微生物根系分泌化合物的确认是此类研究的重点也是难点。目前课题组对于抗逆(重金属、干旱、高寒等)微生物的筛选、功能研究及应用已经取得了初步成果,但对相关机制(特定的根系分泌物及分子机制)的研究仍有待深入。对于我们课题组,该研究对关键根系分泌化合物确认及功能分析过程中,所利用的逻辑及具体方法等具有非常高的参考价值。