本周推荐的文章是黄进课题组每周的文献分享组会上,由范吉兰分享的题为“UCL23 hierarchically regulated by WRKY51-miR528 mediates cadmium uptake, tolerance, and accumulation in rice” 的文章。该文章发表于Cell Reports (中科院一区,IF=7.5,第一作者:Tan, Jingai,通讯作者:Wu, Liang)。

一、研究背景(镉污染:隐形的粮食安全威胁)
镉(Cd)是一种广泛存在于土壤中的重金属污染物,长期通过水稻等农作物进入人体,可能导致肾脏损伤、骨骼疾病等慢性健康风险。因此培育低镉积累的水稻品种,是保障粮食安全的重要课题。
过去虽发现一些与镉积累相关的基因,但这些基因往往同时影响其他必需金属的吸收或导致产量下降,难以直接应用于育种。因此,寻找特异性调控镉吸收且不影响作物生长的基因机制成为研究重点。
二、研究结论
1、WRKY51-miR528-UCL23分子模块调控镉吸收与耐受性的双重机制
(1)UCL23的核心作用:
UCL23是一种铜蛋白,通过促进活性氧(ROS)的积累,负向调控水稻对镉的耐受性(即UCL23表达越高,水稻对镉的敏感性越强),同时正向促进镉的吸收(UCL23表达越高,根系和籽粒镉含量越高)。实验显示,UCL23过表达植株的根系镉含量比野生型高20%-30%,而敲除UCL23后,水稻对镉的耐受性显著增强。

图1 UCL23参与Cd耐受性调控
②miR528的抑制作用:
miR528是一种小分子RNA,通过靶向降解UCL23的mRNA,抑制其表达,从而减少镉吸收并增强镉耐受性。与野生型相比,miR528过表达植株的籽粒镉含量降低约36%,而miR528突变体的镉含量则显著升高。

图2 miR528参与Cd耐受性调控
③WRKY51的双重调控:
WRKY51是一个转录因子,通过两种方式调控UCL23:①直接结合UCL23基因启动子,激活其转录;②结合miR528基因启动子,抑制其表达,间接解除miR528对UCL23的抑制。这种“双重激活”机制确保UCL23在镉胁迫下维持适当表达水平,平衡水稻对镉的吸收与耐受性。
2、UCL23基因变异导致籼稻与粳稻镉积累差异
单倍型分化:
籼稻主要携带UCL23单倍型1(UCL23Hap1),粳稻主要携带单倍型2(UCL23Hap2),后者因编码区插入6个碱基,比前者多2个氨基酸。实验证实,携带UCL23Hap2的水稻(无论籼稻还是粳稻)镉吸收量比UCL23Hap1植株低25%-40%。
分子机制:
UCL23Hap2的蛋白稳定性更高,能更高效地促进ROS积累,从而减少镉吸收。将粳稻的UCL23Hap2导入籼稻后,籼稻根系镉吸收量降低30%,籽粒镉含量降低29%,且不影响产量。
3、敲除WRKY51基因可培育低镉水稻品种
基因编辑应用:通过CRISPR-Cas9敲除WRKY51后,水稻根系镉含量降低40%,籽粒镉含量降低35%,且锌、铁、锰等必需金属元素含量无显著变化,株高、穗粒数等农艺性状与野生型一致。这表明WRKY51是培育低镉水稻的理想靶基因。

图3 WRKY51-miR528-UCL23模块对镉响应的工作模型
三、对课题组的启示
本研究揭示了水稻中一个全新的镉调控网络—WRKY51-miR528-UCL23模块。该机制通过三重作用精准调控镉的吸收与积累,为镉污染土壤的植物修复提供了新策略。对本课题组的启示包括以下几点:
(1)从“单一基因功能”到“层级调控网络”的系统生物学思维
该研究突破传统单基因研究局限,通过转录因子(WRKY51)对靶基因(UCL23)的直接激活与对调控RNA(miR528)的间接抑制,构建了“转录因子-miRNA-功能基因”的三重调控网络。这种多节点互作模型提示课题组在未来的研究中需结合预测等挖掘调控关系,避免孤立解读分子作用;例如解析镉响应基因时,结合表观修饰组学与非编码RNA测序,揭示“DNA-RNA-蛋白”多层级调控逻辑,提升机制研究系统性。
(2)多维度验证体系:构建“分子机制-遗传表型-环境响应”的闭环论证
该研究通过ChIP-qPCR/EMSA验证分子互作、双荧光素酶系统检测转录活性、突变体/过表达材料分析遗传效应,并结合水培与田间试验验证环境适应性,形成了 "体外生化-体内遗传-多环境验证” 的证据链。课题组可借鉴此标准化流程:在基因功能验证中,需同步关注“分子互作的特异性”、“遗传材料的背景一致性”及“环境变量的梯度设计”,确保结论的可靠性与普适性。
最后本课题组早期已有相关关于水稻花青苷蛋白基因UCL的克隆与功能研究,且发现其可能与多种蛋白相互作用、参与花粉壁形成、抗逆境胁迫等多种生命过程。通过该研究提出的“WRKY51-miR528-UCL23介导水稻对Cd胁迫的耐受机制”从分子层面为构建作物Cd响应系统提供了框架,且发现了UCL23这一成员可介导ROS的产生进而调控水稻对Cd的吸收这一功能,未来可对本课题组研究相关家族成员提供方向与思路。