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恭喜博士生李彩容关于北美鹅掌楸高效基因编辑体系建立的研究论文在Plants上顺利发表!
发布时间:2025-02-05

202525号,南京林业大学林木细胞工程课题组在Plants上发表了题为Highly Efficient Homozygous CRISPR/Cas9 Gene Editing Based on Single-Cell-Originated Somatic Embryogenesis in Liriodendron tulipifera的文章,成功开发了一种基于单细胞起源体细胞胚胎发生的CRISPR/Cas9基因编辑技术,应用于北美鹅掌楸基因组改造,取得了最高100%的编辑效率。

本研究通过比对拟南芥PDS基因序列,从北美鹅掌楸基因组中鉴定出六个同源基因,最终成功克隆了其中一个基因LtPDS。该基因包含14个外显子和13个内含子,总长度为23,571 bp。基于靶向特异性,研究人员设计了三个靶点(T1T2T3),并构建了CRISPR/Cas9CRISPR/Cpf1基因编辑载体。

CRISPR/Cas9CRISPR/Cpf1载体分别通过瞬转方法转入鹅掌楸幼苗,观察编辑效率。结果显示,CRISPR/Cas9系统在T1靶点的编辑效率为20%,而CRISPR/Cpf1系统未检测到基因编辑事件。

随后,研究人员利用农杆菌介导的转化方法,将CRISPR/Cas9载体导入北美鹅掌楸的胚性愈伤组织中,通过选择培养基筛选出阳性愈伤组织,并诱导其再生为植株,共获得137株再生植株,其中82.48%表现出白化表型,表明PDS基因被成功敲除。编辑后的白化植株表现出明显的白化和矮化表型,与野生型植株相比,其根系发育不良,叶片生长缓慢且形状不规则。这些表型与PDS基因在类胡萝卜素合成途径中的关键作用一致。

通过PCR扩增和Sanger测序分析了愈伤组织的基因编辑情况。结果显示,T1靶点的编辑效率最高100%(平均64.28%),而在T2靶点的编辑效率最高60%(平均18.57%)T3靶点未检测到编辑事件。而CRISPR/Cpf1系统均未成功敲除。

对再生植株和进一步脱分化诱导形成的愈伤组织的Fast NGS测序结果表明,T1靶点的编辑类型为纯合突变,T2靶点为嵌合突变,T3靶点未发生突变。


该研究成果由南京林业大学林木细胞工程课题组完成,博士生李彩容为该论文的第一作者,施季森教授和陈金慧教授为共同通讯作者。该工作得到“十四五”国家重点研发计划(2021YFD2200103)、国家自然科学基金(32071784)及江苏省高校优势学科建设工程(PAPD)的联合资助。

起稿:李彩容

编辑:郝兆东


Reference:

Cairong Li, Pengshuo Jiang, Jiaji Zhang, Dingjie Yang, Lu Lu, Zhaodong Hao, Yingxuan Ma, Jisen Shi, and Jinhui Chen. Highly Efficient Homozygous CRISPR/Cas9 Gene Editing Based on Single-Cell-Originated Somatic Embryogenesis in Liriodendron tulipifera. Plants, 2025, 14(3): 472. https://doi.org/10.3390/plants14030472

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