单细胞转录组测序（scRNA-seq）技术的快速发展，为分析细胞异质性、转录组复杂性和动态调控机制提供了前所未有的工具。与当前基于末端标签的scRNA-seq方法相比，高分辨率全长scRNA-seq在实现转录本水平定量、剪接调控、等位基因表达、亚型多样性、转录突变和全面RNA类型鉴定的分子分辨率方面具有显著优势。它已广泛应用于完善细胞命运决定模型。此外，将全长scRNA-seq技术与多组学和空间分辨测序相结合，将更精确地破译细胞相互作用及其跨模态分子机制。本综述重点介绍了跨越poly（A+）mRNA到总RNA全长捕获系统的高分辨率scRNA-seq的最新迭代技术、跨多组学和空间维度的精确分析方法及其在肿瘤生物学、生殖医学、免疫学和发育生物学中的基础研究和临床应用。文中最后还讨论了当前的挑战和未来前景。总之，高分辨率scRNA-seq正逐渐从描述性工具过渡到机制解剖和治疗创新的核心实验范式。随着技术瓶颈的突破和学科交叉的融合，全长全转录组的格局将继续在生命科学和医学研究中开辟更广阔的应用前景