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党开同同学基于组合DNA Barcode的组织微区样本转录组测序文库构建结果发表于Biotechnology Journal(DOI: 10.1002/biot.202300294),祝贺!
发布时间:2023-10-30

   scRNA-seq与显微切割技术相结合,已成为空间转录组分析的重要工具。然而,对于单细胞分辨率样本,因高昂的实验成本和繁琐的操作流程,使得这种方法以满足不断提高的实验通量。为此,我们提出了Combinational DNA Barcode(CDB-seq结合Smart-3SEQ和CDB磁性微进行中低通量空间转录分析。本文全面比较了CDB磁珠的制备条件和相关因素,并将CDB-seq应用于RNA提取液,FF和FFPE小鼠脑组织样本,CDB-seq能以一种简单、经济高效的方式获得数十个显微解剖样本的转录组图谱为未来的空间转录组学研究提供了一种前景广阔的方法。