在神经科学研究中，转录组分析通常使用死亡的脑组织。然而我们无法确定在死亡与样本采集的间隔期（即死后间隔期，PMI）内，脑细胞发生了何种变化，这给数据的准确性带来了巨大挑战。本研究旨在通过模拟这一过程，利用snRNA-seq系统描绘了小鼠死后不同时长（PMI）脑组织中细胞组成与基因表达的动态变化，精确解析PMI对大脑细胞的影响。我们发现mRNA在细胞死亡后的降解过程中表现出比rRNA更高的稳定性，打破了传统认知。此外，少突胶质细胞（负责产生髓鞘，绝缘神经纤维）及其前体细胞（OPCs，负责生成新的少突胶质细胞）的数量随着PMI延长而急剧减少，表明这类细胞对缺血缺氧环境尤为敏感。值得注意的是，在细胞死亡过程中，核糖体蛋白基因被广泛且显著地激活，其表达水平在死后约36h达到高峰。这可能是细胞在死亡应激下试图启动的修复机制，或是细胞死亡通路被激活的标志。本研究的相关发现不仅为理解死后缺氧缺血的分子机制提供了新证据，也为RNA降解样本的转录组学研究提供了参考。