Methamphetamine (Meth) seeking progressively increases after withdrawal (incubation of Meth craving), but the transcriptional mechanisms that contribute to this incubation are unknown. Here we used RNA-sequencing to analyze transcriptional profiles associated with incubation of Meth craving in central amygdala (CeA) and orbitofrontal cortex (OFC), two brain areas previously implicated in relapse to drug seeking. We trained rats to self-administer either saline (control condition) or Meth (10 days; 9 h/day, 0.1 mg/kg/infusion). Next, we collected brain tissue from CeA and OFC on withdrawal day 2 (when Meth seeking is low and non-incubated) and on day 35 (when Meth seeking is high and incubated), for subsequent RNA-sequencing. In CeA, we identified 10-fold more differentially expressed genes (DEGs) on withdrawal day 35 than day 2. These genes were enriched for several biological processes, including protein ubiquitination and histone methylation. In OFC, we identified much fewer expression changes than in CeA, with more DEGs on withdrawal day 2 than on day 35. There was a significant overlap between upregulated genes on withdrawal day 2 and downregulated genes on withdrawal day 35 in OFC. Our analyses highlight the CeA as a key region of transcriptional regulation associated with incubation of Meth seeking. In contrast, transcriptional regulation in OFC may contribute to Meth seeking during early withdrawal. Overall, these findings provide a unique resource of gene expression data for future studies examining transcriptional mechanisms in CeA that mediate Meth seeking after prolonged withdrawal.

中文翻译：

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在甲基苯丙胺渴望的培养过程中，中央杏仁核和眶额皮质的全基因组转录谱。

戒断后寻求甲基苯丙胺（Meth）逐渐增加（渴望进行Meth孵化），但是导致这种孵化的转录机制尚不清楚。在这里，我们使用RNA测序来分析与在中央杏仁核（CeA）和眶额叶皮层（OFC）（两个先前牵涉到寻求药物复发的大脑区域）中渴望食欲的方法相关的转录谱。我们训练了大鼠自我给药盐水（对照条件）或方法（10天； 9小时/天，0.1毫克/千克/输注）。接下来，我们在停药第2天（当寻找甲基数较低且未孵育的昆虫）和第35天（当寻找甲基数较高且未孵育的昆虫）撤离第2天时从CeA和OFC收集脑组织，用于后续的RNA测序。在CeA中，我们在退出第35天时发现的差异表达基因（DEG）比第2天多了10倍。这些基因富集了多个生物学过程，包括蛋白质泛素化和组蛋白甲基化。在OFC中，我们发现表达变化比CeA少得多，撤药第2天的DEG比第35天更多。在OFC中，撤药第2天的上调基因与撤药第35天的下调基因之间存在明显的重叠。我们的分析强调，CeA是与寻找方法孵化相关的转录调控的关键区域。相反，OFC中的转录调控可能有助于提早戒断期间的甲基化。总体而言，这些发现为将来研究CeA的转录机制提供了独特的基因表达数据资源，这些转录机制在长时间戒断后介导了Meth的寻求。包括蛋白质泛素化和组蛋白甲基化。在OFC中，我们发现表达变化比CeA少得多，撤药第2天的DEG比第35天更多。在OFC中，撤药第2天的上调基因与撤药第35天的下调基因之间存在明显的重叠。我们的分析强调，CeA是与寻找方法孵化相关的转录调控的关键区域。相反，OFC中的转录调控可能有助于提早戒断期间的甲基化。总体而言，这些发现为将来研究CeA的转录机制提供了独特的基因表达数据资源，这些转录机制在长时间戒断后介导了Meth的寻求。包括蛋白质泛素化和组蛋白甲基化。在OFC中，我们发现表达变化比CeA少得多，撤药第2天的DEG比第35天更多。在OFC中，撤药第2天的上调基因与撤药第35天的下调基因之间存在明显的重叠。我们的分析强调，CeA是与寻找方法孵化相关的转录调控的关键区域。相反，OFC中的转录调控可能有助于提早戒断期间的甲基化。总体而言，这些发现为将来研究CeA的转录机制提供了独特的基因表达数据资源，这些转录机制在长时间戒断后介导了Meth的寻求。在OFC中，第2天撤药的上调基因与第35天撤药的下调基因之间存在明显的重叠。我们的分析强调，CeA是与寻找方法孵化相关的转录调控的关键区域。相反，OFC中的转录调控可能有助于提早戒断期间的甲基化。总体而言，这些发现为将来研究CeA的转录机制提供了独特的基因表达数据资源，这些转录机制在长时间戒断后介导了Meth的寻求。在OFC中，第2天撤药的上调基因与第35天撤药的下调基因之间存在明显的重叠。我们的分析强调，CeA是与寻找方法孵化相关的转录调控的关键区域。相反，OFC中的转录调控可能有助于提早戒断期间的甲基化。总体而言，这些发现为将来研究CeA的转录机制提供了独特的基因表达数据资源，这些转录机制在长时间戒断后介导了Meth的寻求。OFC中的转录调控可能有助于提早戒断期间的甲基化。总体而言，这些发现为将来研究CeA的转录机制提供了独特的基因表达数据资源，这些转录机制在长时间戒断后介导了Meth的寻求。OFC中的转录调控可能有助于提早戒断期间的甲基化。总体而言，这些发现为将来研究CeA的转录机制提供了独特的基因表达数据资源，这些转录机制在长时间戒断后介导了Meth的寻求。