We aimed to determine whether the TCR repertoires of Crohn's disease (CD) patients contain highly prevalent disease-specific T-cell clonotypes reflective of the characteristic and highly shared aberrant serum antibody reactivity to gut commensal flagellin antigens. The CD4 TCRβ CDR3 sequence repertoires from active CD (n = 20) and ulcerative colitis (UC) (n = 10) patients were significantly more diverse, and individual sequences over-represented, compared to healthy controls (HC) (n = 97). While a very small number of expanded public CDR3 sequences are highly shared between active CD and UC, the majority of significantly expanded TCRβ CDR3 clonotypes are private to CD and UC patients with equivalent prevalence among IBD patients. Further defining TCR clonotypes by Vβ-CDR3 linkage showed significant differences in the TCR repertoires between UC and CD. Flagellin antigen exposure induced expansion of several TCRβ CDR3 sequences in CD4 cells from a flagellin-seropositive subject including sequences highly shared by or relatively private to CD (and UC) patients. These data suggest that flagellin-reactivity contributes to the expansion of a small number of CD4 clonotypes but does not support flagellin antigens as predominantly driving CD4 cell proliferation in CD. Disease-specific expanded TCRβ CDR3 clonotypes characterize CD and UC and the shared exposure to the gamut of gut microbial antigens.

中文翻译：

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扩展的 TCRβ CDR3 克隆型可区分克罗恩病和溃疡性结肠炎患者。

我们的目的是确定克罗恩病 (CD) 患者的 TCR 库是否包含高度流行的疾病特异性 T 细胞克隆型，这些克隆型反映了对肠道共生鞭毛蛋白抗原的特征性和高度共享的异常血清抗体反应性。与健康对照 (HC) (n = 97) 相比，活动性 CD (n = 20) 和溃疡性结肠炎 (UC) (n = 10) 患者的 CD4 TCRβ CDR3 序列库明显更加多样化，并且个体序列过多. 虽然极少数扩展的公共 CDR3 序列在活动性 CD 和 UC 之间高度共享，但大多数显着扩展的 TCRβ CDR3 克隆型是 CD 和 UC 患者私有的，在 IBD 患者中的流行率相当。通过 Vβ-CDR3 连接进一步定义 TCR 克隆型表明 UC 和 CD 之间的 TCR 库存在显着差异。鞭毛蛋白抗原暴露诱导了来自鞭毛蛋白血清反应阳性受试者的 CD4 细胞中几个 TCRβ CDR3 序列的扩增，包括 CD（和 UC）患者高度共享或相对私有的序列。这些数据表明，鞭毛蛋白反应性有助于少量 CD4 克隆型的扩增，但不支持鞭毛蛋白抗原主要驱动 CD 中的 CD4 细胞增殖。疾病特异性扩展的 TCRβ CDR3 克隆型表征 CD 和 UC 以及共同暴露于肠道微生物抗原的范围。鞭毛蛋白抗原暴露诱导了来自鞭毛蛋白血清反应阳性受试者的 CD4 细胞中几个 TCRβ CDR3 序列的扩增，包括 CD（和 UC）患者高度共享或相对私有的序列。这些数据表明，鞭毛蛋白反应性有助于少量 CD4 克隆型的扩增，但不支持鞭毛蛋白抗原主要驱动 CD 中的 CD4 细胞增殖。疾病特异性扩展的 TCRβ CDR3 克隆型表征 CD 和 UC 以及共同暴露于肠道微生物抗原的范围。鞭毛蛋白抗原暴露诱导了来自鞭毛蛋白血清反应阳性受试者的 CD4 细胞中几个 TCRβ CDR3 序列的扩增，包括 CD（和 UC）患者高度共享或相对私有的序列。这些数据表明，鞭毛蛋白反应性有助于少量 CD4 克隆型的扩增，但不支持鞭毛蛋白抗原主要驱动 CD 中的 CD4 细胞增殖。疾病特异性扩展的 TCRβ CDR3 克隆型表征 CD 和 UC 以及共同暴露于肠道微生物抗原的范围。