The drug–gene interaction database (DGIdb, www.dgidb.org) consolidates, organizes and presents drug–gene interactions and gene druggability information from papers, databases and web resources. DGIdb normalizes content from 30 disparate sources and allows for user-friendly advanced browsing, searching and filtering for ease of access through an intuitive web user interface, application programming interface (API) and public cloud-based server image. DGIdb v3.0 represents a major update of the database. Nine of the previously included 24 sources were updated. Six new resources were added, bringing the total number of sources to 30. These updates and additions of sources have cumulatively resulted in 56 309 interaction claims. This has also substantially expanded the comprehensive catalogue of druggable genes and anti-neoplastic drug–gene interactions included in the DGIdb. Along with these content updates, v3.0 has received a major overhaul of its codebase, including an updated user interface, preset interaction search filters, consolidation of interaction information into interaction groups, greatly improved search response times and upgrading the underlying web application framework. In addition, the expanded API features new endpoints which allow users to extract more detailed information about queried drugs, genes and drug–gene interactions, including listings of PubMed IDs, interaction type and other interaction metadata.

中文翻译：

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DGIdb 3.0：重新设计和扩展药物基因相互作用数据库

药物基因相互作用数据库（DGIdb，www.dgidb.org）整合，组织和展示了药物，基因相互作用和来自论文，数据库和网络资源的基因可药物性信息。DGIdb对来自30个不同来源的内容进行规范化，并允许用户友好的高级浏览，搜索和过滤，以通过直观的Web用户界面，应用程序编程界面（API）和基于公共云的服务器映像轻松访问。DGIdb v3.0代表数据库的主要更新。以前包含的24个资源中的9个已更新。添加了六个新资源，从而使来源总数达到30个。这些来源的更新和添加已累计导致56 309个交互声明。这也大大扩展了DGIdb中包含的可药物基因和抗肿瘤药物基因相互作用的综合目录。随着这些内容的更新，v3.0已对其代码库进行了重大改进，包括更新的用户界面，预设的交互搜索过滤器，将交互信息整合到交互组中，大大缩短了搜索响应时间并升级了基础Web应用程序框架。此外，扩展的API具有新的端点，使用户可以提取有关所查询药物，基因和药物与基因相互作用的更多详细信息，包括PubMed ID，相互作用类型和其他相互作用元数据的列表。包括更新的用户界面，预设的交互搜索过滤器，将交互信息整合到交互组中，大大缩短了搜索响应时间并升级了基础Web应用程序框架。此外，扩展的API具有新的端点，使用户可以提取有关所查询药物，基因和药物与基因相互作用的更多详细信息，包括PubMed ID，相互作用类型和其他相互作用元数据的列表。包括更新的用户界面，预设的交互搜索过滤器，将交互信息整合到交互组中，大大缩短了搜索响应时间并升级了基础Web应用程序框架。此外，扩展的API具有新的端点，使用户可以提取有关所查询药物，基因和药物与基因相互作用的更多详细信息，包括PubMed ID，相互作用类型和其他相互作用元数据的列表。